Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALKBH4Q9NXW9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALKBH4Q9NXW9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms