Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A12Q9NXJ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A12Q9NXJ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms