Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED29Q9NX70 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MED29Q9NX70 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms