Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL11Q9NVR0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL11Q9NVR0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms