Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ASF1BQ9NVP2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ASF1BQ9NVP2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms