Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX18Q9NVP1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDX18Q9NVP1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDX18Q9NVP1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms