Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMLHEQ9NVH6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMLHEQ9NVH6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms