Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PARVAQ9NVD7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PARVAQ9NVD7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms