Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM30AQ9NV96 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM30AQ9NV96 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms