Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS9Q9NV88 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INTS9Q9NV88 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms