Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATG3Q9NT62 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG3Q9NT62 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG3Q9NT62 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms