Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EMILIN3Q9NT22 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EMILIN3Q9NT22 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EMILIN3Q9NT22 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms