Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RRP7BPQ9NSQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
RRP7BPQ9NSQ0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RRP7BPQ9NSQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms