Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CENPMQ9NSP4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CENPMQ9NSP4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CENPMQ9NSP4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms