Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SEMA3GQ9NS98 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3GQ9NS98 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3GQ9NS98 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3GQ9NS98 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms