Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMPRSS4Q9NRS4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms