Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR3

CDC42SE2, CDC42 small effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42SE2Q9NRR3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42SE2Q9NRR3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42SE2Q9NRR3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms