Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA8

EIF4ENIF1, Eukaryotic translation initiation factor 4E transporter, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
EIF4ENIF1Q9NRA8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF4ENIF1Q9NRA8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF4ENIF1Q9NRA8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms