Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF4Q9NR80 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARHGEF4Q9NR80 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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