Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF3Q9NR23 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF3Q9NR23 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms