Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM10Q9NQV6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM10Q9NQV6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM10Q9NQV6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM10Q9NQV6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM10Q9NQV6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM10Q9NQV6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM10Q9NQV6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM10Q9NQV6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM10Q9NQV6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms