Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PFDN4Q9NQP4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PFDN4Q9NQP4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PFDN4Q9NQP4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms