Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DMRT3Q9NQL9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DMRT3Q9NQL9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms