Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RTN4Q9NQC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RTN4Q9NQC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RTN4Q9NQC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms