Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

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Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP13A2Q9NQ11 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP13A2Q9NQ11 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP13A2Q9NQ11 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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