Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
A4GALTQ9NPC4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A4GALTQ9NPC4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A4GALTQ9NPC4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms