Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTA1Q9NP79 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VTA1Q9NP79 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTA1Q9NP79 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTA1Q9NP79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VTA1Q9NP79 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms