Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM60AQ9NP50 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM60AQ9NP50 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM60AQ9NP50 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM60AQ9NP50 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM60AQ9NP50 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM60AQ9NP50 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM60AQ9NP50 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms