Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVK-5Q9HDB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVK-5Q9HDB9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms