Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD248Q9HCU0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD248Q9HCU0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD248Q9HCU0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms