Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXNA4Q9HCM2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNA4Q9HCM2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms