Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ELL3Q9HB65 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ELL3Q9HB65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms