Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKRIP1Q9H875 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRKRIP1Q9H875 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKRIP1Q9H875 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms