Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUDS3Q9H7L9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SUDS3Q9H7L9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms