Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C11orf49Q9H6J7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C11orf49Q9H6J7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms