Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FNDC4Q9H6D8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNDC4Q9H6D8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms