Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEMA6BQ9H3T3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA6BQ9H3T3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA6BQ9H3T3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms