Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3E2

SNX25, Sorting nexin-25, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX25Q9H3E2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX25Q9H3E2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX25Q9H3E2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX25Q9H3E2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms