Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF39Q9H2S5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF39Q9H2S5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF39Q9H2S5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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