Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GANQ9H2C0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GANQ9H2C0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GANQ9H2C0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms