Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K0

RBSN, Rabenosyn-5, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBSNQ9H1K0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RBSNQ9H1K0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBSNQ9H1K0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms