Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC90BQ9GZT6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC90BQ9GZT6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC90BQ9GZT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms