Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CEP44Q9C0F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CEP44Q9C0F1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms