Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TM6SF2Q9BZW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM6SF2Q9BZW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM6SF2Q9BZW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms