Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRNKL1Q9BZJ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRNKL1Q9BZJ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRNKL1Q9BZJ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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