Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PUS3Q9BZE2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PUS3Q9BZE2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PUS3Q9BZE2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms