Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFIH1Q9BYX4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFIH1Q9BYX4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFIH1Q9BYX4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms