Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDHR2Q9BYE9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDHR2Q9BYE9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDHR2Q9BYE9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms