Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PCGF6Q9BYE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PCGF6Q9BYE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PCGF6Q9BYE7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PCGF6Q9BYE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms