Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABARAPL3Q9BY60 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABARAPL3Q9BY60 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms